资讯 | 湖南农大成功绘制辣椒泛基因组图谱和基因组变异图谱-凯发k8一触即发

2023-12-15 09:12:16 3

近日,中国工程院院士、湖南农业大学教授邹学校科研团队联合美国康奈尔大学boyce thompson研究所教授费章君团队,绘制了来自5个驯化辣椒品种及其近缘野生辣椒品种的500个辣椒泛基因组图谱和基因组变异图谱,为栽培辣椒和野生辣椒物种的群体结构、驯化、种群分化和基因渐渗等提供了见解,提高了业界对辣椒多样性和驯化的认识,为未来的功能研究和辣椒属物种分子育种提供了全面而有价值的基因组资源。

辣椒是人类最早栽培的作物之一,包括一年生辣椒、中华辣椒、灌木状辣椒、浆果辣椒和茸毛辣椒共5个驯化物种。辣椒的驯化被认为发生在多个起源中心独立驯化,但此前的大规模辣椒群体研究主要集中在单一的栽培种capsicum annuumvar. annuum上,这使得辣椒不同栽培种和野生辣椒种之间的系统发育关系、遗传多样性、种群分化等仍不清楚。

据介绍,该研究首先利用pacbio长读测序技术和高通量染色体构象捕获图谱,对来自annuum、baccatum 和pubescens分支的3份辣椒材料进行高质量基因组组装,构建泛基因组图谱。

该研究以泛基因组图谱为参考,构建了辣椒的单碱基分辨率变异图谱;利用分子证据厘清了此前未明确的62个物种和9个品种的种质分类,修正了80个种质的错误分类。

成果论文近期发表于《自然—通讯》,湖南农业大学园艺学院教授刘峰、园艺学院与美国康奈尔大学联合培养的博士后赵建涛为论文共同第一作者,邹学校、费章君和boyce thompson研究所博士后吴珊为共同通讯作者。另有来自康奈尔大学、美国农业部植物遗传资源保护中心、浙江农林大学、华中农业大学等的研究者参与研究。湖南农业大学为论文第一完成单位。(来源:华声在线)

网站地图