资讯 | 合肥研究院揭示新型dna链置换反应-凯发k8一触即发

2023-09-25 09:09:57 4

近期,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心研究员张钠课题组,依托稳态强磁场实验装置(shmff),揭示了g四链体中自发进行基于非经典hoogsteen氢键配对的新型dna链置换反应,实现了g四链体重组装。该团队解析了由一条靶标链和两条富g短链探针构成异三聚g四链体的核磁共振溶液结构。相关研究成果发表在《美国化学会志》(jacs)上。

dna链置换反应通常基于经典watson-crick碱基配对原则,以一条dna单链将另一条序列相似的目标dna单链从所处的dna双螺旋结构中置换出来。这种在dna双链螺旋结构中进行的常规链置换反应,已被广泛应用于纳米分子组装、生物传感器、基因诊断与分子治疗等领域。

不同于dna经典双螺旋结构,g四链体是由富含鸟嘌呤g的核酸序列折叠而成的独特拓扑结构,在人类基因组中分布广泛,在生物、医药等领域备受关注。g四链体具有丰富的结构多样性,根据核酸链聚集度可分为单聚、二聚或四聚g四链体,极少有三聚g四链体。g四链体结构具有优良的稳定性,通常不与其他富g序列进行链置换,长期以来g四链体被认为对富g链置换反应有惰性。

源于人类微管蛋白β2基因启动子区的dna序列tub10 d(cagggagggt)在k 溶液中完全折叠成具有良好热稳定性(tm值57.7°c)的全平行自二聚g四链体。研究发现,尽管该g四链体在室温下足够稳定,但它在新型hoogsteen氢键配对的链置换反应中并非惰性,而是可作为起始反应物自发地接受双份富g短链探针p1 d(tggga)的链置换进攻,获得由一条靶标链tub10和两条探针链p1构成的全平行异三聚g四链体终产物tub10/2p1,实现g四链体重组装。

科研人员利用液相核磁共振技术解析了全原子精细结构,揭示了不同dna富g序列在相互识别时存在着靶标链与探针链之间独特的1:2结合模式。富g短链探针p1与传统反义探针相比具有更高的结合特异性,能特异性识别全平行二聚g四链体。富g短链探针p1可同时进攻双螺旋中的富g链与富c链,自发地将tub10从双链螺旋中捕获出来,形成异三聚g四链体产物tub10/2p1。

该研究揭示了由双份富g短链探针同时参与基于hoogsteen氢键配对方式自发进行的新型链置换反应,拓展并补充了由watson-crick配对介导的常规核酸链置换反应,突破了g四链体呈现富g链置换惰性的传统认知。该成果为dna纳米材料领域研究奠定了新的理论基础和实践基础,解决了目前多为相同富g链自组装的不足,利于获得更复杂、更多功能的全新纳米组装结构,并为靶向g四链体的新型富g探针设计提供了新思路。

研究工作得到国家自然科学基金和国家重点研发计划等的支持。(来源:)

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